我们成功鉴定了新型的全长IGHA、IGLV、IGLC和IGK序列。虽然我们从两只猫中获得的Ig序列扩展了我们对猫Ig库和Ig基因使用的了解,但还需要使用不同的猫品种进行更广泛的研究,以确定我们收集的数据是否可以广泛应用。我们观察到来自3个IGHV亚群的表达,其中大多数(72%)序列属于IGHV1亚群。这些发现表明,猫的IGHV多样性来源于使用更多的胚系亚群基因,而犬的IGHV库中超过90%的序列来源于单个犬IGHV亚群(IGHV1),其余来自IGHV240。

使用的9个IGHV基因位于B3染色体(NC_018728.2)和D1染色体(NC_018732.2)。预计会使用B3上的IGHV基因,但使用D1染色体上的基因是出乎意料的,因为不应该在多于一个染色体上存在IGHV基因。我们推测,映射到D1染色体的可变基因是由于基因组序列组装错误,因为没有Ig重链常量区域映射到D1染色体,而从两个染色体派生的转录本之间的V、D和J-C基因片段的重组不太可能发生。由于串联阵列和保守序列的存在,映射免疫球蛋白基因在组装基因组时具有挑战性。牛基因组在不同染色体上有2个IGH位点。功能性的IGH位点位于牛染色体BTA21上。位于牛染色体BTA11上的第二个位点是截断的。因此,另一个染色体上存在第二个功能性的猫IGH位点似乎不太可能。完整的猫IgM和IgA重链常量区域基因位于B3染色体上。完整的IGHG常量区域也映射到B3,尽管一些片段(≤63%的IGHG常量区域长度)映射到尚未定位的基因组脚手架序列上。我们还鉴定了四个克隆序列,在猫参考基因组中没有显著的匹配结果;这些基因可能在用于生成参考基因组的个体猫中缺失;或者,猫参考基因组组装中的缺口可能解释了这些序列的缺失。

翻译并优化一下文本:We successfully identified novel full-length IGHA IGLV IGLC and IGK sequences Although the Ig sequences we obtained from 2 cats expand our knowledge of the feline Ig repertoire and Ig gene u

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