翻译：Molecular analysis of partial VP-2 gene amplified from rectal swab samples of diarrheic dogs in Pakistan confirms the circulation of canine parvovirus genetic variant CPV-2a and detects sequences o

在巴基斯坦，对腹泻狗的直肠拭子样本进行的部分VP-2基因的分子分析确认了犬细小病毒遗传变异体CPV-2a的循环，并检测到了猫泛白细胞减少症病毒（FPV）的序列。

背景：由于犬细小病毒（CPV）引起的狗的感染是一种高度传染性的疾病，病死率很高。本研究对从费萨拉巴德地区的感染家养和流浪狗的直肠拭子样本中分离出的630 bp的部分VP2基因进行了详细的遗传学分析。监测病毒的重要性在于，病毒感染的持续流行可能与新的致病毒株的出现有关。

方法：本研究于2014-15年在巴基斯坦费萨拉巴德地区的不同地区收集了40个腹泻狗的直肠拭子样本，并通过免疫层析法筛查CPV的存在。这些狗大多是流浪狗，表现出腹泻症状。提取病毒DNA并使用基因特异性引物对部分VP2基因进行PCR扩增。扩增的片段被克隆到pTZ57R/T（Fermentas）中，并进行完全测序。序列通过Lasergene DNA分析软件包（v8; DNAStar Inc., Madison, WI, USA）进行分析和组装。

结果：免疫层析法结果显示，40只狗中有33只（82%）为CPV阳性。我们成功从25个样本中扩增出一个630 bp的片段。在这25个样本中，检测到了CPV-2a的序列，显示部分VP2蛋白中氨基酸替代Ser297Ala和氨基酸（426-Asn）的存在。有趣的是，BLAST分析显示在已经对新CPV-2a阳性的3个样本中检测到了猫泛白细胞减少症病毒（FPV）的序列，与GenBank中其他FPV序列的序列同源性达到99%。

结论：系统发育分析显示，部分CPV-VP-2基因与来自中国、印度、日本和乌拉圭的病毒聚类，鉴定出一种新变异体，而这3个FPV序列与来自葡萄牙、南非和美国的病毒具有直接的祖先关系。有趣的观察是，CPV与商业疫苗株聚类不同。通过这项工作，我们在分子水平上对巴基斯坦流行的CPV有了更好的了解。检测到FPV可能是真正的共感染案例，或者是由于摄入被污染食物造成的双重存在。