cpptraj中model multi如何使用

在cpptraj中，[model | multi]用于处理多个模型（trajectory）的情况。以下是使用[model | multi]的示例代码：

parm input.prmtop

# 读取多个模型
trajin input1.nc
trajin input2.nc
trajin input3.nc

# 使用[model | multi]命令
model multi

# 执行后续的cpptraj命令
# 例如计算RMSD
rmsd reference.pdb out rmsd.dat :1-10

# 退出[model | multi]模式
model single

在上面的示例中，首先使用trajin命令读取了三个模型文件（input1.nc、input2.nc和input3.nc）。然后使用[model | multi]命令进入多模型模式。在该模式下，可以执行一系列的cpptraj命令，例如计算RMSD。最后使用model single命令退出多模型模式，回到单模型模式。

注意，[model | multi]模式下的cpptraj命令会对所有的模型执行，输出结果会合并在一起。