空间转录组技术中基于LCM的常用技术有哪些
在空间转录组技术中,基于LCM(laser capture microdissection,激光捕获显微切割)的常用技术包括:
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LCM-PCR:激光捕获显微切割结合聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)。利用LCM技术将感兴趣的细胞从组织切片中切割出来,然后进行RNA提取和PCR分析,以获得细胞特定的转录组信息。
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LCM-RNA测序:激光捕获显微切割结合RNA测序技术。通过LCM技术切割出感兴趣的细胞,然后进行RNA提取、逆转录和测序,以获得细胞特定的转录组信息。
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LCM-微阵列:激光捕获显微切割结合微阵列技术。将LCM切割的细胞收集到微量的试管中,然后进行RNA提取和微阵列分析,以获得细胞特定的转录组信息。
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LCM-蛋白质组学:激光捕获显微切割结合蛋白质组学技术。通过LCM技术将感兴趣的细胞从组织中切割出来,然后进行蛋白质提取和质谱分析,以获得细胞特定的蛋白质组信息。
这些基于LCM的技术可以帮助研究人员获得特定细胞类型的转录组信息,进一步了解细胞的功能和调控机制。
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