在R语言中举个例子做Welch’s t-test输入文件是7个样本的基因丰度文件这7个样本分成了两组详细过程
假设我们有一个基因丰度文件,包含7个样本的数据,并且这7个样本被分成了两组。下面是一个使用R语言进行Welch's t-test的示例代码:
# 读取数据
data <- read.csv("gene_abundance.csv")
# 分组
group1 <- c(1, 2, 3) # 第一组样本的索引
group2 <- c(4, 5, 6, 7) # 第二组样本的索引
# 提取基因丰度数据
group1_data <- data[group1,]
group2_data <- data[group2,]
# Welch's t-test
result <- t.test(group1_data, group2_data)
# 打印结果
print(result)
在上述代码中,我们首先使用read.csv函数读取包含基因丰度的文件。然后,我们将样本分成两组,分别用group1和group2表示。接下来,我们从原始数据中提取出属于两个组的样本数据。最后,我们使用t.test函数进行Welch's t-test,并将结果打印出来。
需要注意的是,上述代码中使用了默认的参数设置。如果你想要使用其他参数,可以在t.test函数中指定
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