在R语言中进行Welch's t-test,可以使用t.test()函数来实现。下面是一个详细的例子:

假设我们有两组基因表达数据,分别为组1和组2。我们的目标是检验这两组数据之间是否存在差异基因。

首先,我们需要创建两个向量来代表组1和组2的基因表达数据。假设组1的基因表达数据为c(1.2, 2.3, 3.4, 4.5, 5.6),组2的基因表达数据为c(0.9, 2.1, 3.3, 4.2, 6.1)。

# 创建组1和组2的基因表达数据向量
group1 <- c(1.2, 2.3, 3.4, 4.5, 5.6)
group2 <- c(0.9, 2.1, 3.3, 4.2, 6.1)

接下来,我们可以使用t.test()函数进行Welch's t-test。该函数需要指定两组数据的参数(x和y),并设置参数paired为FALSE以进行非配对样本的t-test。

# 进行Welch's t-test
result <- t.test(x = group1, y = group2, paired = FALSE)

最后,我们可以通过访问result对象的属性来获取检验结果。其中,result$statistic表示t统计量的值,result$p.value表示P值。

# 打印检验结果
cat("Welch's t-test:\n")
cat("t statistic:", result$statistic, "\n")
cat("P-value:", result$p.value, "\n")

这个例子中,我们使用了组1和组2的基因表达数据进行了Welch's t-test,并打印了检验结果。你可以将这个例子作为参考,根据自己的数据进行Welch's t-test的实现

在R语言中举个例子做Welch’s t-test的两组差异基因检验详细说明

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