下面是一个使用C++的Boost库和Asio从NCBI高速下载FASTQ文件的示例代码:

#include <iostream>
#include <fstream>
#include <boost/asio.hpp>

using boost::asio::ip::tcp;

void download_fastq(const std::string& accession) {
  boost::asio::io_context io_context;
  tcp::resolver resolver(io_context);
  tcp::socket socket(io_context);

  // 解析NCBI服务器的地址和端口
  tcp::resolver::results_type endpoints = resolver.resolve("ftp.ncbi.nlm.nih.gov", "ftp");
  
  // 连接到NCBI服务器
  boost::asio::connect(socket, endpoints);

  // 发送下载请求
  std::string request = "RETR /sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/" + accession.substr(0, 3) + "/" + accession + "/" + accession + ".fastq.gz\r\n";
  socket.send(boost::asio::buffer(request));

  // 创建本地文件
  std::ofstream outfile(accession + ".fastq.gz", std::ios::binary);

  // 接收并写入数据
  std::array<char, 8192> buffer;
  boost::system::error_code error;
  while (socket.read_some(boost::asio::buffer(buffer), error)) {
    outfile.write(buffer.data(), buffer.size());
  }

  // 关闭socket和文件
  socket.close();
  outfile.close();

  if (error != boost::asio::error::eof) {
    throw boost::system::system_error(error);
  }
}

int main() {
  std::string accession = "SRR000001"; // 输入你想要下载的accession号码
  try {
    download_fastq(accession);
    std::cout << "FASTQ文件下载完成" << std::endl;
  } catch (std::exception& e) {
    std::cerr << "下载失败: " << e.what() << std::endl;
  }

  return 0;
}

请确保已经安装了Boost库,并在编译时链接了相关的库文件。此代码将下载指定accession号对应的FASTQ文件,并将其保存在当前目录下,文件名为accession号加上".fastq.gz"后缀

根据给定的accession号使用c++的boost库的asio从ncbi高速下载对应的fastq文件

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