我有咸水湖BDH、BRTLGD和BRTLGX三个不同湖泊的宏基因组样本这三个样本是从不同咸水湖中提取的或者在后续实验中使用的方法相同这算不算咸水湖的三个生物学重复呢？
根据描述，BDH、BRTLGD和BRTLGX是从不同咸水湖中提取的宏基因组样本，或者使用了相同的后续实验方法。从生物学重复的角度来看，这三个样本算作不同咸水湖的样本，而不是同一咸水湖的重复样本。因此，它们不算咸水湖的生物学重复。要进行生物学重复，应该在同一咸水湖中获取多个样本，并使用相同的实验方法进行处理。
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