salmon运行出的基因COUNT文件先对行求和将基因在各个样本中数目综总和为0的删除然后每个数值加上04再四舍五入取整在R中怎么做？

要在R中完成这个任务，你可以按以下步骤进行操作：

1. 读取基因COUNT文件：使用read.table()函数或类似的函数将基因COUNT文件读入R中。假设你将数据存储在名为data的数据框中。

2. 求和并删除总和为0的基因：使用rowSums()函数计算每行的总和，并使用该总和筛选出总和不为0的基因。假设你将筛选后的数据存储在名为filtered_data的数据框中。

filtered_data <- data[rowSums(data) != 0, ]

3. 对每个数值加上0.4并四舍五入取整：使用apply()函数将filtered_data中的每个数值加上0.4，并使用round()函数将结果四舍五入取整。

rounded_data <- round(apply(filtered_data, 2, function(x) x + 0.4))

在上述代码中，2表示按列应用函数，function(x) x + 0.4是应用的函数，它将每个数值加上0.4。

最终，rounded_data将是每个数值加上0.4并四舍五入取整后的结果。

请注意，这只是一种可能的实现方式，你可以根据你的数据和需求进行必要的调整