修改这句话硫酸氢盐测序能够获取单碱基对分辨率的全基因组甲基化谱覆盖率最广但其测序的成本非常昂贵。2005年Meissner提出将限制性酶切和亚硫酸氢盐转化相结合的简化基因组甲基化测序Reduced representation bisulfite sequencingRRBS96。该方法用甲基化不敏感的MspⅠ酶对主要位于DNA启动子区的CCGG位点进行酶切采用凝胶电泳富集40 ~ 220bp长的

硫酸氢盐测序是一种获取全基因组甲基化谱的方法，具有单碱基对分辨率高的特点，但成本较高。2005年，Meissner提出了一种简化的基因组甲基化测序方法，即限制性酶切和亚硫酸氢盐转化相结合的RRBS方法[96]。该方法使用甲基化不敏感的MspⅠ酶对主要位于DNA启动子区的CCGG位点进行酶切，然后采用凝胶电泳富集40 ~ 220bp长的CpG片段，并进行末端修复、接头和Index连接，最后进行亚硫酸氢盐转化和测序[96]。基因表达受甲基化最显著的区域通常位于启动子的CpG岛区域，RRBS方法针对大多数启动子区的CCGG位点的甲基化分析，既能降低基因组复杂性和序列冗余，又能降低测序成本，同时满足大多数研究的目标[97]。2015年，Sørensen实验团队还开发了一种名为SMAP的一站式分析软件，该软件包括质控、比对、差异甲基化位点/区域的鉴定、注释和可视化结果输出等常规分析功能，还具有SNP和等位基因特异性甲基化分析（ASM）功能[98]。