MOVERSMutateResidue name=mutres0 new_res=new_res0 target=target0preserve_atom_coords=trueMutateResidue name=mutres1 new_res=new_res1 target=target1preserve_atom_coords=trueMutateResidue name=mutres2 n
这是一个XML格式的文件,描述了一系列分子模拟的操作。每个操作都由一个标签表示,其中包含了该操作的具体信息和参数设置。
具体操作包括:
- MutateResidue:用新的氨基酸替换目标残基。
- ConstraintSetMover:添加约束条件。
- AtomCoordinateCstMover:修复侧链坐标。
- PackRotamersMover:重新打包氨基酸侧链构象。
- RotamerTrialsMinMover:进行氨基酸侧链构象的最小化。
- MinMover:进行最小化操作。
- PackRotamersMover:进行软重打包操作。
每个操作的具体参数和目标都使用占位符(%%)表示,需要根据具体情况进行替换。
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