MRE-seq是一种结合甲基化敏感性酶消化和测序技术的方法,它筛选大小在40~220bp之间的片段进行测序,可用于检测全基因组DNA的甲基化水平[77]。MRE-seq利用Bowtie2或BWA进行比对,并利用R包msgbsR提取限制性内切酶识别的切割位点,通过比较片段的覆盖丰度来估算DNA的相对甲基化水平[78]。另外,之前提到的HELP技术[79]也可以与测序技术进一步结合使用。

修改这句话MRE-seq将甲基化敏感性酶消化与测序技术相结合筛选大小片段为40 ~ 220bp之间的片段进行测序可用于检测全基因组DNA甲基化水平77。MRE-seq通过Bowtie2或BWA比对后利用R包msgbsR提取限制性内切酶识别的切割位点通过比较片段的覆盖丰度来估算相对的DNA甲基化水平78。此外上文提到的HELP79技术也可以和测序技术进一步的组合。

原文地址: https://www.cveoy.top/t/topic/ijOX 著作权归作者所有。请勿转载和采集!

免费AI点我,无需注册和登录