第一个基于芯片的全基因组筛查肿瘤细胞中高甲基化CpG岛的方法是差异甲基化杂交技术(differential methylation hybridization,DMH)[71]。该方法首先利用MseI酶对基因组DNA进行消化,由于该酶对GC富集区域不敏感,处理后可以较好地保留CGI。然后选择小于200bp的序列片段连接接头,再使用甲基化敏感的限制性内切酶HpaII(或BstUI)进行切割。未甲基化的DNA会被切割,因此在使用接头序列进行PCR扩增时无法扩增,而甲基化的DNA则可以。接着,采用不同的荧光染料标记实验和对照组的PCR产物,将它们与等量的扩增子混合,再与CGI芯片进行杂交。通过比较荧光强度的强弱来检测甲基化状态是否存在差异。该方法可用于甲基化定性检测,但由于酶切不完全的可能性,可能会导致假阳性或假阴性结果,因此需要进行后续的鉴定。

修改这句话第一个基于芯片的全基因组筛查肿瘤细胞中高甲基化CpG岛的方法是差异甲基化杂交技术differential methylation hybridizationDMH71。该方法首先利用MseI对基因组DNA进行消化因该酶识别位点对GC富集区域不敏感处理后可以很大程度上保留CGI。选取小于200bp的序列片段连接接头后用甲基化敏感的限制性内切酶HpaII或BstUI切割。未甲基化的DNA被切

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