这个错误是因为estimateR.default()函数只能接受整数(计数)作为输入,而你的数据可能是小数或字符型数据。你需要确保你的数据是整数型。如果你的数据是小数型,你可以使用round()函数将其四舍五入为整数。如果你的数据是字符型,你需要将其转换为整数型。你可以使用as.integer()函数将字符型数据转换为整数型数据。以下是一个示例代码:

# 将数据四舍五入为整数
data <- round(data)

# 或者将字符型数据转换为整数型数据
data <- as.integer(data)

# 然后再运行alphaDiversity()函数
test1 <- alphaDiversity(otutab = data, 
                         siteInCol = TRUE,
                         taxhead = "taxonomy", 
                         threshold = 1, 
                         percent = FALSE, 
                         write = T,
                         as.numeric)

请注意,这只是一个示例代码,具体取决于你的数据类型和需求。你需要根据你的实际情况来调整代码

R语言报错 test1 - alphaDiversityotutab = data + siteInCol = TRUE+ taxhead = taxonomy + threshold = 1 + perce

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