修改下面文字 CAGE-seq是专门针对mRNA中所有的TSS进行鉴定的一项技术在选择性启动子的分析而言可以说是最优的选择。公共数据中HCC的CAGE数据非常稀缺且难以获得这就导致了HCC中选择性启动子的分析具有一定程度的研究门槛。正是基于这种研究的痛点新加坡基因组研究所Patrick Tan教授团队开发了proActiv的算法仅仅通过RNA-seq数据即可计算启动子的活性。该团队将PCAWG、

CAGE-seq是一种专门用于鉴定mRNA中所有转录起始位点（TSS）的技术，对于选择性启动子的分析来说是最佳选择。然而，目前公共数据中关于肝细胞癌（HCC）的CAGE数据非常有限且难以获取，这增加了研究选择性启动子的门槛。为了解决这个问题，新加坡基因组研究所的Patrick Tan教授团队开发了“proActiv”算法，该算法仅通过RNA-seq数据就能计算启动子的活性。该团队将来自PCAWG、TCGA和GTEx队列的18,468个样本中的启动子活性量化，并与公开的H3K4me3染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）数据以及来自不同细胞系和组织的CAGE标签数据进行了比较，结果显示具有较高的一致性。其他研究也进一步证明了该方法的可靠性。尽管该方法可能不是计算启动子活性最准确的方式，但在客观研究条件有限的情况下，它仍然是一种优秀的计算启动子活性的手段。