修改下面文字我们进一步对HCC中所有mrAPs的甲基化水平是否具有预后评估功能进行分析。在189个mrAPs中剔除TCGA数据集的450K无表达的探针数据后筛选出171个mrAPs启动子区的CpG位点进行下一步分析。研究结果显示836143171mrAPs的甲基化水平具有预后评估价值图3-23 A详细信息见附表8。通过与原癌基因和抑癌基因数据库基因列表对比171个mrAPs对应的基因中有8个基因被
我们进一步分析了HCC中所有mrAPs的甲基化水平是否具有预后评估功能。我们从189个mrAPs中剔除了TCGA数据集的450K无表达的探针数据,然后筛选出171个mrAPs启动子区的CpG位点进行下一步分析。研究结果显示,83.6%(143/171)的mrAPs的甲基化水平具有预后评估价值(图3-23 A),详细信息请参见附表8。通过与原癌基因和抑癌基因数据库的基因列表进行对比,我们发现171个mrAPs对应的基因中有8个基因被纳入原癌基因数据库,其中有6个mrAPs的甲基化水平具有预后评估价值;另外,有11个基因被纳入抑癌基因数据库,其中10个mrAPs的甲基化水平具有预后评估价值(图3-23 B)。癌基因RARA的高表达可能受到低甲基化的调控,低甲基化状态预示着较差的临床结果(图3-23 C)。而对于抑癌基因APC,甲基化程度越低,预后越好(图3-24 D)。在ONG和TSG列表之外的基因中,我们发现PDZK1启动子活性与甲基化水平显著相关,PDZK1低甲基化组的生存趋势更差(图3-23 E)。
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