edo - enrichKEGGnamesfoldchanges organism = hsa pvalueCutoff = 005 qvalueCutoff = 005-- No gene can be mapped-- Expected input gene ID 21941072034125509183440-- return NULL 怎么改
您可以尝试以下方法来解决这个问题:
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检查输入的基因名字是否正确。确保您输入的基因名字与KEGG数据库中的基因名字匹配。您可以使用其他基因名字数据库,如NCBI Gene或Ensembl,来验证基因名字的准确性。
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检查您所选择的物种是否正确。确保您选择的物种与KEGG数据库中的物种一致。您可以使用organism参数来指定正确的物种名称。
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检查pvalueCutoff和qvalueCutoff参数的值。您可以尝试增加这些值,以便允许更多的基因被映射到KEGG通路。
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检查您的R包版本是否最新。有时旧版本的R包可能无法正确地映射基因到KEGG通路。您可以尝试更新R包到最新版本,或者使用其他的R包来进行KEGG富集分析。
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检查您的网络连接是否正常。有时候由于网络问题,R包无法从KEGG数据库中获取基因映射信息。您可以尝试连接其他网络来解决这个问题。
如果以上方法都没有解决您的问题,您可以尝试使用其他的KEGG富集分析工具或者咨询相关领域的专家来获取帮助。
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