可以使用 BioPython 中的 SeqIO 模块将 aln 文件转化为 fasta 文件。以下是示例代码:

from Bio import SeqIO

# 读取 aln 文件
alignment = SeqIO.parse('example.aln', 'clustal')

# 将 alignment 对象中的序列写入 fasta 文件
SeqIO.write(alignment, 'example.fasta', 'fasta')

在此示例中,我们使用 SeqIO.parse() 函数读取 aln 文件,并将其解析为一个 SeqRecord 对象的列表。然后,我们使用 SeqIO.write() 函数将这些 SeqRecord 对象写入 fasta 文件。

如何将Clustal Aln 文件转换为 Fasta 格式

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