EnzDes 中的 Params 和 Rotamer Libraries：作用和意义

是的，执行 EnzDes 时会准备 Params 和 Rotamer Libraries。Params 包含了氨基酸和配体的力场参数，Rotamer Libraries 包含了氨基酸侧链的不同构象。这些信息对于计算蛋白质-配体相互作用非常重要，因为它们可以用来计算分子间的相互作用能和构象能。在 EnzDes 中，这些信息被用来生成配体的不同构象和评估它们与蛋白质的相互作用。