Rosetta 命令行参数解析 - jnk_pp_1_001.pdb 文件处理

Rosetta 命令行参数解析：jnk_pp_1_001.pdb 文件处理

该命令行参数用于在输入文件 'jnk_pp_1_001.pdb' 上运行 Rosetta 程序，并存储输出结果。

参数解析:

• @FLAGS.txt: Rosetta 程序的参数文件，包含各种设置选项。
• -in:file:s input/jnk_pp_1_001.pdb: 指定输入文件路径为 'input/jnk_pp_1_001.pdb'。
• -out:path:pdb work/jnk_pp_1_001/$(Process): 指定输出文件存储路径为 'work/jnk_pp_1_001/'，并使用 '$(Process)' 作为文件夹名称后缀。
• -run:seed_offset $(Process): 使用不同的随机种子来运行程序，每个进程使用不同的随机种子。
• -out:suffix _$(Process): 为每个进程生成不同的输出文件后缀，以 '_$(Process)' 结尾。
• Queue 10: 将任务分成 10 个子任务并行运行。

总结:

该命令行参数使用 Rosetta 程序对 'jnk_pp_1_001.pdb' 文件进行处理，并根据不同的进程设置不同的随机种子和输出文件后缀。最后，将任务分成 10 个子任务并行运行，以提高效率。

注意: '$(Process)' 是一个变量，代表当前进程的编号。