cpptraj DSSP分析结果解读:EBGHITS含义详解

在使用cpptraj进行蛋白质结构分析时,DSSP算法常被用于分析蛋白质的二级结构。DSSP分析结果中会包含一些标记,例如EBGHITS,用于表示不同的二级结构类型。

EBGHITS各字母含义详解:

  • **E:*扩展链 (Extended strand),代表β-折叠结构。 **B:*β桥 (Beta bridge),代表β-折叠结构中的氢键。 **G:*3-10螺旋 (3-10 helix)。 **H:*α-螺旋 (Alpha helix)。 **I:*π-螺旋 (Pi helix)。 **T:*转角 (Turn)。 **S:**结构杂乱或无规则 (Bend or loop)。

通过分析DSSP结果中的EBGHITS标记,我们可以了解蛋白质中不同氨基酸残基的二级结构类型,进而研究蛋白质的结构与功能关系。

cpptraj DSSP分析结果解读:EBGHITS含义详解

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