Rosetta Warning: 解决 'Subsampling proton chi expansion' 警告的方案

Rosetta 在设计和最小化过程中可能会出现 'Subsampling proton chi expansion' 的警告。这通常是因为 Rosetta 在设计和最小化过程中发现了过多的旋转体（rotamers），导致计算量过大。

以下是解决这个问题的几种方法：

1. 调整参数：可以尝试调整设计和最小化过程中的参数，例如减少设计和最小化的循环次数，或者调整旋转体库的大小。

2. 使用更小的分子：如果可能的话，可以考虑使用较小的分子进行计算，以减少计算量。

3. 使用分布式计算：如果计算资源允许，可以考虑使用分布式计算来加速计算过程。

4. 使用更高性能的计算机：如果计算资源有限，可以尝试使用更高性能的计算机或者并行计算来加速计算过程。

5. 联系Rosetta开发者：如果以上方法都无法解决问题，可以联系Rosetta开发者寻求帮助，他们可能会提供更详细的解决方案或者对代码进行修改。