Rosetta软件输出路径错误问题解决方法

Rosetta软件输出路径错误：/outdir_15路径不存在

问题描述：

在超算平台/GFPS8p/taoy/zhang_jian/zj_cns_rosetta/test文件夹下运行Rosetta软件，预期输出路径为/GFPS8p/taoy/zhang_jian/zj_cns_rosetta/test，但程序报错显示输出到一个不存在的/outdir_15路径：

output file name: /outdir_15/1q91_CHGW_d1_mod__DE_1.pdb

ERROR: Unable to open file: /outdir_15/1q91_CHGW_d1_mod__DE_1.pdb

ERROR:: Exit from: src/protocols/jobdist/JobDistributors.cc line: 696
Error: (15) [ ERROR ] Must call shutdown() when finished using job distributor!

[ ERROR ]: Caught exception:


File: src/protocols/jobdist/JobDistributors.cc:696
[ ERROR ] UtilityExitException
ERROR: Unable to open file: /outdir_15/1q91_CHGW_d1_mod__DE_1.pdb

可能原因及解决方法：

1. Rosetta程序代码错误:
   • 检查程序代码中与输出路径相关的部分，特别是src/protocols/jobdist/JobDistributors.cc文件第696行附近，确认是否指定了/outdir_15路径。
   • 如果发现错误，修改代码以指定正确的输出路径。
2. 环境变量或配置文件问题:
   • 检查Rosetta软件的配置文件，确认是否存在与输出路径相关的设置，例如环境变量或配置文件中的默认输出路径。
   • 如果发现错误，修改相关设置以指定正确的输出路径。
3. 程序异常:
   • 查看程序的其他输出信息，特别是错误日志，以获取更多关于错误原因的提示。
   • 尝试使用调试工具跟踪程序运行过程，定位导致错误发生的具体代码段。
4. 联系Rosetta开发者或技术支持:
   • 如果无法自行解决问题，可以尝试联系Rosetta软件的开发者或相关技术支持寻求帮助，提供详细的错误信息和程序运行环境。

建议:

• 在运行Rosetta软件之前，仔细阅读软件文档，了解程序的默认设置和配置选项。
• 使用版本控制系统管理程序代码，方便回滚到之前的版本。
• 保留程序运行日志，以便于排查问题。