Rosetta 蛋白质设计中 Level 4 的 -ex1 和 -ex2 文件区别

-ex1 和 -ex2 是 Rosetta 软件用于蛋白质设计的两个文件，但仅凭文件名无法确定它们在 level 4 设计中的区别。

根据您提供的信息，-ex1 和 -ex2 都属于 level 4。在 Rosetta 中，level 代表设计复杂度和精确度。level 4 通常意味着更复杂的结构和序列约束，以及更高的自由度，从而获得更精准可靠的设计结果。

尽管 -ex1 和 -ex2 都属于 level 4，但它们可能在以下方面存在差异:

• 设计算法: -ex1 和 -ex2 可能采用不同的算法进行蛋白质设计。
• 约束条件: 两种文件可能应用不同的结构或序列约束条件，从而影响最终设计方案。
• 参数设置: -ex1 和 -ex2 可能使用不同的参数设置，例如能量函数权重或搜索空间大小，进而影响设计结果。

若要明确区分 -ex1 和 -ex2 在 Rosetta level 4 设计中的区别，需要更多关于这两个文件内容和用途的信息。 您可以尝试查找相关文档、教程或咨询 Rosetta 社区以获取更详细的解答。