C++计算矩阵列之间的MIC系数并存储列名

本文提供了一个C++函数，用于计算给定矩阵中每两列之间的最大信息系数(MIC)。该函数将结果存储在一个矩阵中，其中每一行包含两个列名和它们对应的MIC值。

**代码:**cpp#include #include #include #include #include <omp.h>// 假设你已经包含了必要的头文件，例如Eigen库和MINE库

// 使用Eigen库定义矩阵类型template<typename T, int Options>using matrix = Eigen::Matrix<T, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic, Options>;

// 计算MIC的函数matrix<std::tuple<std::string, std::string, double>, Eigen::RowMajor> calc_mic(const matrix<double, Eigen::RowMajor>& mat, const std::vectorstd::string& col_names, int threads) { // 当样本量小于6个时，终止程序 if(mat.rows() < 6){ std::cerr << 'error: the number of data rows should be greater than 5.' << std::endl; return {}; // 返回空矩阵 } if(mat.cols() < 2){ std::cerr << 'error: the number of data columns should be greater than 1.' << std::endl; return {}; // 返回空矩阵 }

// 创建结果矩阵，使用tuple存储列名和MIC值    matrix<std::tuple<std::string, std::string, double>, Eigen::RowMajor> result_with_names(mat.cols() * (mat.cols() - 1) / 2, 3);

// 使用OpenMP进行并行计算    omp_set_num_threads(threads);    #pragma omp parallel for    for (size_t i = 0; i < mat.cols(); ++i) {        MINE mine(0.5, 15, EST_MIC_APPROX); // 创建MINE对象        for (size_t j = i + 1; j < mat.cols(); ++j) {             // 计算两列之间的MIC            double x[mat.rows()];            double y[mat.rows()];            for (size_t k = 0; k < mat.rows(); ++k) {                x[k] = mat(k, i);                y[k] = mat(k, j);            }            mine.compute_score(x, y, mat.rows());

        // 将结果存储到结果矩阵中            size_t index = i * (mat.cols() - 1) - i * (i + 1) / 2 + j - i - 1; // 计算存储位置            result_with_names(index, 0) = col_names[i];            result_with_names(index, 1) = col_names[j];            result_with_names(index, 2) = mine.mic();        }    }

return result_with_names;}

使用方法:

将上述代码添加到你的C++项目中。2. 确保你已经包含了必要的头文件，例如Eigen库和MINE库。3. 使用你的数据初始化一个矩阵 mat 和一个包含列名的字符串向量 col_names。4. 调用函数 calc_mic(mat, col_names, threads) 计算MIC，其中 threads 是你想要使用的线程数。5. 函数将返回一个矩阵，其中每一行包含两个列名和它们对应的MIC值。

注意:

该代码使用了OpenMP进行并行计算，可以提高计算速度。* 你需要根据你的数据类型和库函数修改代码。* 确保你的数据满足MIC计算的条件，例如样本量大于5。

希望这段代码能够帮助你计算矩阵列之间的MIC系数并存储列名。