基于硅的D-果糖-6-磷酸水解酶的设计及活性增强机制的计算研究

摘要

D-果糖-6-磷酸水解酶 (F6Pase) 是一种重要的酶，在糖代谢中起着至关重要的作用。为了提高其催化效率，本研究设计了一种新型的基于硅的F6Pase，并利用计算方法深入研究了其活性增强机制。通过分子对接、分子动力学模拟和自由能计算等方法，我们揭示了硅取代对酶结构、底物结合和催化反应的影响。结果表明，硅取代可以增强酶与底物的相互作用，稳定过渡态，从而提高酶的催化活性。本研究为设计新型高效的F6Pase提供了理论依据，并为理解硅基酶的催化机制提供了新的见解。

关键词

D-果糖-6-磷酸水解酶, 硅基酶, 酶设计, 活性增强, 计算模拟, 分子动力学