PPI networks We collected protein–protein interactions from CPDB78 STRING-db79 IRefIndex80 Multinet81 and PCNet82 Depending on the network we only considered high confidence interactions For the CPDB
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本文收集了多个蛋白质相互作用网络,包括CPDB78、STRING-db79、IRefIndex80、Multinet81和PCNet82。
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不同的网络根据其特点和可信度,只保留了高置信度的相互作用。
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对于CPDB网络,只保留了得分大于0.5的相互作用;对于STRING-db网络,保留了得分大于0.85的相互作用。
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Multinet和旧版本的IRefIndex(v.9.0)是从Hotnet2 github存储库中收集的。对于最新版本的IRefIndex(v.15.0),只考虑了二元(两个蛋白质之间)和人类相互作用。
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PCNet没有进一步处理,因为其作者建议将其作为共识网络。
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