C++ 使用MINE算法计算数据矩阵列之间的MIC系数并输出对称矩阵
本代码示例演示如何使用C++和MINE算法计算数据矩阵中每列两两之间的最大信息系数（MIC），并将结果保存到txt文件的对称矩阵中。
代码cpp#include #include #include #include #include #include #include
using namespace std;
// 读取带有行名和列名的数据矩阵vector<vector> readDataMatrix(const string& filename) { ifstream file(filename); vector<vector> dataMatrix; map<string, int> columnNameToIndex; string line; if (file.is_open()) { // 读取第一行，获取列名 if (getline(file, line)) { stringstream ss(line); string columnName; int index = 0; while (ss >> columnName) { columnNameToIndex[columnName] = index; index++; } } // 读取数据行，并将数据存储到二维向量中 while (getline(file, line)) { stringstream ss(line); double value; vector row; while (ss >> value) { row.push_back(value); } dataMatrix.push_back(row); } file.close(); } return dataMatrix;}
int main(int argc, char **argv) { string filename = 'data.txt'; // 数据文件名 // 读取数据矩阵 vector<vector> dataMatrix = readDataMatrix(filename); int n = dataMatrix[0].size(); // 列数 // 创建对称矩阵 vector<vector> symmetricMatrix(n, vector(n, 0.0)); // 创建MINE对象 MINE mine(0.6, 15, EST_MIC_APPROX); // 计算每列两两之间的mic系数，并存储到对称矩阵中 for (int i = 0; i < n; i++) { for (int j = i; j < n; j++) { double x[n]; double y[n]; // 从数据矩阵中获取第i列和第j列的数据 for (int k = 0; k < n; k++) { x[k] = dataMatrix[k][i]; y[k] = dataMatrix[k][j]; } // 计算mic系数 mine.compute_score(x, y, n); // 将mic系数存储到对称矩阵中 symmetricMatrix[i][j] = mine.mic(); symmetricMatrix[j][i] = mine.mic(); } } // 将对称矩阵输出到txt文件 ofstream outputFile('output.txt'); if (outputFile.is_open()) { for (int i = 0; i < n; i++) { for (int j = 0; j < n; j++) { outputFile << symmetricMatrix[i][j] << ' '; } outputFile << '
'; } outputFile.close(); } return 0;}
说明
- 代码首先定义了一个
readDataMatrix 函数，用于读取带有行名和列名的数据矩阵，并将其存储到一个二维向量中。* main 函数中，首先调用 readDataMatrix 函数读取数据矩阵。* 然后，创建 MINE 对象，并使用嵌套循环遍历数据矩阵的每一列，计算每列两两之间的MIC系数。* 计算得到的MIC系数存储在一个对称矩阵中。* 最后，将对称矩阵输出到 output.txt 文件中。
注意
- 本代码示例假设数据文件的格式为每行一个样本，列之间用空格分隔，第一行为列名。* 您需要将代码中的
data.txt 替换为您实际的数据文件名，并确保数据文件的格式符合要求。* 您需要安装 cppmine 库才能编译和运行此代码。
希望本代码示例能够帮助您使用C++和MINE算法计算数据矩阵列之间的MIC系数。