甲基化芯片检测:高分辨率、全面覆盖、简便分析
甲基化芯片检测具有单碱基位点的高分辨率,覆盖程度从27K、450K发展到850K。目前的芯片能够检测到853307个基因组甲基化位点,对基因各个元件有较全面的覆盖。2014年,Beck团队开发了一种名为'chAMP'的R包,可以直接从甲基化芯片原始idat输出数据开始进行数据质控、均一化、差异甲基化位点(DMC)和DMR的鉴定、注释和可视化。甲基化芯片由于其高灵敏度、特异性、低成本和易于分析等优势,备受各研究中心青睐。
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