Rosetta 脚本解析：蛋白质结构改造示例

这是一个Rosetta脚本的示例，用于定义一个作业（Job）。下面是对该脚本的详细解析：

1. <JobDefinitionFile>：指定了这是一个Job定义文件。

2. <Job>：定义了一个作业。

3. <Input>：定义了输入文件。

   • <PDB filename='1hzy.pdb'/>：指定了输入的PDB文件名为'1hzy.pdb'。这是一个蛋白质结构文件。

4. <Output>：定义了输出文件。

   • <PDB filename='0101010101010101' path='/dev/null' pdb_gz='true'/>：指定了输出的PDB文件名为'0101010101010101'，输出路径为'/dev/null'（即输出到空设备），并且启用了PDB压缩。

5. <Options>：定义了选项参数。

   • <parser__script_vars value='target0=72A new_res0=ILE target1=98A new_res1=PHE target2=220A new_res2=HIS target3=223A new_res3=HIS target4=237A new_res4=LEU target5=269A new_res5=LEU target6=272A new_res6=PHE target7=283A new_res7=MET'/>：定义了解析器脚本变量。这些变量用于指定需要进行的结构改造操作，例如将特定残基替换为新的残基。

   • <out__file__scorefile value='scores/1.sc'/>：指定了输出评分文件的路径和文件名。

以上是对该Rosetta脚本的详细解析。该脚本的具体功能可能需要根据实际情况进行进一步分析。