Rosetta 脚本解析：突变操作与输出文件命名

Rosetta是一款功能强大的蛋白质结构预测和设计软件包，通过脚本文件来指导软件进行蛋白质结构分析和设计。本文将详细解析一个Rosetta脚本命令，并解释其具体含义。

命令：'rosetta_scripts.mpi.macosclangrelease @mutate.flags -out:suffix _0000 -parser:script_vars target0=13B new_res0=TYR target1=65B new_res1=ILE'

解析：

• 'rosetta_scripts.mpi.macosclangrelease' 是Rosetta的可执行文件。
• '@mutate.flags' 是一个脚本文件，用于指定蛋白质突变信息。
• '-out:suffix _0000' 是一个参数，用于指定输出文件的后缀名为'_0000'。
• '-parser:script_vars target0=13B new_res0=TYR target1=65B new_res1=ILE' 是一个参数，用于指定两个蛋白质突变操作：
  • 将第13个氨基酸替换为酪氨酸(TYR)。
  • 将第65个氨基酸替换为异亮氨酸(ILE)。

总结：这个命令利用Rosetta的脚本文件进行蛋白质结构分析和设计，其中包含了两个蛋白质的突变操作，并将输出文件命名为原始文件名加'_0000'。