PyTorch代码中实现TN(真负例)计算
以下是完整的代码,包含了TN的计算部分,并对原代码进行了完善,使其更易于理解和应用:
def eval_net(net, dataset, slicetotal, batch_size=12, gpu=True):
'''Evaluation without the densecrf with the dice coefficient'''
net.eval()
start = time.time()
dice_ = torch.zeros(14).cuda()
jac_ = torch.zeros(14).cuda()
NE = torch.zeros(14).cuda()
JNE = torch.zeros(14).cuda()
accuracy_ = torch.zeros(14).cuda()
precision_ = torch.zeros(14).cuda()
recall_ = torch.zeros(14).cuda()
specificity_ = torch.zeros(14).cuda()
print(1)
with torch.no_grad():
for i, b in enumerate(batch(dataset, batch_size)):
imgs = np.array([k[0] for k in b]).astype(np.float32)
true_masks = np.array([k[1] for k in b])
imgs = torch.from_numpy(imgs)
imgs = imgs.unsqueeze(1)
true_masks = torch.from_numpy(true_masks)
pre_masks_eval = torch.zeros(true_masks.shape[0], 14, 256, 256)
true_masks_eval = torch.zeros(true_masks.shape[0], 14, 256, 256)
batchshape = true_masks.shape[0]
batch_dice = torch.zeros(14).cuda()
if gpu:
imgs = imgs.cuda()
true_masks = true_masks.cuda()
net.cuda()
output_img = net(imgs)
input = output_img.cuda()
pre_masks = input.max(1)[1].float() # 索引代表像素所属类别的数字
for ak in range(14):
if ak == 0:
continue
pre_masks_eval[:, ak] = (pre_masks == ak)
true_masks_eval[:, ak] = (true_masks == ak)
premasks = pre_masks_eval[:, ak].view(true_masks.shape[0], -1)
truemasks = true_masks_eval[:, ak].view(true_masks.shape[0], -1)
intersection = premasks * truemasks
TP = intersection.sum(1)
FP = premasks.sum(1) - TP
FN = truemasks.sum(1) - TP
TN = torch.zeros(14).cuda()
for bk in range(true_masks.shape[0]):
TN[ak] = (batchshape - TP[bk] - FP[bk] - FN[bk])
if TP[bk] == 0 and FP[bk] == 0 and FN[bk] == 0:
NE[ak] += 1
JNE[ak] += 1
else:
batch_dice[ak] = batch_dice[ak] + 2 * TP[bk] / (2 * TP[bk] + FP[bk] + FN[bk])
jac_[ak] = jac_[ak] + TP[bk] / (TP[bk] + FP[bk] + FN[bk])
dice_ = dice_ + batch_dice
for knum in range(14):
dice_[knum] = dice_[knum] / (slicetotal - NE[knum])
jac_[knum] = jac_[knum] / (slicetotal - JNE[knum])
end = time.time()
print('time used:', end - start)
return dice_, jac_
代码说明:
- 在代码中添加了
TN = torch.zeros(14).cuda()变量,用于存储真负例的数量。 - 在计算 TP、FP、FN 后,使用
TN[ak] = (batchshape - TP[bk] - FP[bk] - FN[bk])计算每个类的真负例数量。 - 由于代码中已经对每个类的 TP、FP、FN 进行了累加,因此 TN 的计算也是针对每个类进行的。
TN 计算方法:
TN 代表真负例,即模型预测为负例,实际也为负例的样本数量。在图像分割任务中,负例指的是预测结果与真实结果不匹配的像素。
代码中的 TN 计算逻辑:
- batchshape: 表示一个批次中样本的数量,也就是像素矩阵的第一个维度。
- TP[bk]、FP[bk]、FN[bk]: 分别表示每个样本中,预测为正例且实际也为正例的像素数量、预测为正例但实际为负例的像素数量、预测为负例但实际为正例的像素数量。
- TN[ak]: 通过
batchshape - TP[bk] - FP[bk] - FN[bk]计算得到,表示该批次中预测为负例且实际也为负例的像素数量,也就是每个样本中 TN 的累加结果。
其他指标:
代码中除了 TN 外,还计算了其他一些常见的图像分割评估指标,包括:
- TP (真阳性): 预测为正例,实际也为正例的样本数量。
- FP (假阳性): 预测为正例,但实际为负例的样本数量。
- FN (假阴性): 预测为负例,但实际为正例的样本数量。
- Dice系数: 用来衡量预测结果与真实结果的重叠程度,取值范围为 0 到 1,数值越大表示重叠程度越高。
- Jaccard系数: 也称为交并比 (IoU),用来衡量预测结果与真实结果的重叠比例,取值范围为 0 到 1,数值越大表示重叠比例越高。
注意:
- 代码中假设每个样本都包含 14 个类别,因此需要针对每个类别进行单独的计算。
- 代码中的
slicetotal表示总共需要评估的样本数量。 - 代码中的
gpu参数用于指定是否使用 GPU 进行计算。 - 代码中的
batch(dataset, batch_size)函数用于将数据集分割成批次,并返回一个迭代器,用于遍历每个批次的数据。
总结:
本文详细介绍了如何使用 PyTorch 计算图像分割任务中的 TN 指标,并提供了完整的代码示例。代码中的其他指标计算和评估过程也十分清晰,可以帮助读者更好地理解图像分割任务的评估方法。
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