Python代码实现:计算图像分割模型的TN值

在图像分割任务中,除了常用的TP、FP、FN指标外,TN(真负类率)也是一个重要的评估指标。本文将介绍如何在Python代码中计算TN值,并提供完整的代码示例。

代码实现

以下代码展示了如何在PyTorch框架下计算TN值,并结合Dice系数和Jaccard系数的计算,完整地评估图像分割模型的性能:

def eval_net(net, dataset, slicetotal, batch_size=12, gpu=True):
    '''使用Dice系数评估模型,不使用densecrf。'''

    net.eval()
    start = time.time()
    dice_ = torch.zeros(14).cuda()
    jac_ = torch.zeros(14).cuda()
    NE = torch.zeros(14).cuda()
    JNE = torch.zeros(14).cuda()
    TN = torch.zeros(14).cuda()  # 添加TN计算

    accuracy_ = torch.zeros(14).cuda()
    precision_ = torch.zeros(14).cuda()
    recall_ = torch.zeros(14).cuda()
    specificity_ = torch.zeros(14).cuda()

    print(1)
    with torch.no_grad():
        for i, b in enumerate(batch(dataset, batch_size)):

            imgs = np.array([k[0] for k in b]).astype(np.float32)
            true_masks = np.array([k[1] for k in b])

            imgs = torch.from_numpy(imgs)
            imgs = imgs.unsqueeze(1)
            true_masks = torch.from_numpy(true_masks)

            pre_masks_eval = torch.zeros(true_masks.shape[0], 14, 256, 256)
            true_masks_eval = torch.zeros(true_masks.shape[0], 14, 256, 256)
            batchshape = true_masks.shape[0]

            batch_dice = torch.zeros(14).cuda()
            if gpu:
                imgs = imgs.cuda()
                true_masks = true_masks.cuda()
                net.cuda()

            output_img = net(imgs)
            input = output_img.cuda()
            pre_masks = input.max(1)[1].float()  # 索引代表像素所属类别的数字
            for ak in range(14):
                if ak == 0:
                    continue
                pre_masks_eval[:, ak] = (pre_masks == ak)
                true_masks_eval[:, ak] = (true_masks == ak)
                premasks = pre_masks_eval[:, ak].view(true_masks.shape[0], -1)
                truemasks = true_masks_eval[:, ak].view(true_masks.shape[0], -1)

                intersection = premasks * truemasks
                TP = intersection.sum(1)
                FP = premasks.sum(1) - TP
                FN = truemasks.sum(1) - TP
                TN[ak] = (batchshape * 256 * 256 - TP - FP - FN).sum()  # 计算TN

                for bk in range(true_masks.shape[0]):
                    if TP[bk] == 0 and FP[bk] == 0 and FN[bk] == 0:
                        NE[ak] += 1
                        JNE[ak] += 1
                    else:
                        batch_dice[ak] = batch_dice[ak] + 2 * TP[bk] / (2 * TP[bk] + FP[bk] + FN[bk])
                        jac_[ak] = jac_[ak] + TP[bk] / (TP[bk] + FP[bk] + FN[bk])

            dice_ = dice_ + batch_dice

        for knum in range(14):
            dice_[knum] = dice_[knum] / (slicetotal - NE[knum])
            jac_[knum] = jac_[knum] / (slicetotal - JNE[knum])
    end = time.time()
    print('time used:', end - start)

    return dice_, jac_

代码解读

  1. TN计算: 在循环内部,我们使用公式 TN = (batchshape * 256 * 256 - TP - FP - FN) 计算TN值,其中 batchshape * 256 * 256 代表每个批次的像素总数。
  2. 其他指标计算: 代码中同时计算了Dice系数和Jaccard系数,用于更全面地评估模型性能。
  3. GPU加速: 代码支持GPU加速,可以显著提高计算效率。

总结

本文介绍了如何在Python代码中计算图像分割模型的TN值,并提供了完整的代码示例。该代码可方便地集成到您的项目中,用于评估模型性能。

Python代码实现:计算图像分割模型的TN值

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