DNA 去甲基化是一个复杂的过程,其中一部分是被动发生的,即 DNA 维持甲基化 DNMT1 的失控导致去甲基化。另一部分是主动发生的。最初发现的主动去甲基化机制是通过 5mC 在胞嘧啶核苷脱氨酶/载脂蛋白 B mRNA 编辑复合物 (AID/APOBEC) 的作用下,脱氨酶和羟化作用将 5mC 转变为胸腺嘧啶,产生 G/T 突变,然后通过碱基切除修复 (BER) 通路进行修复。研究表明,Aid 基因敲除的小鼠可以存活并具有正常的生育功能,这表明还存在其他机制参与 DNA 的主动去甲基化。Rao 团队的研究揭示了转位酶 TET 在主动去甲基化过程中的作用。TET 酶能够将 5mC 羟化为 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC),然后进一步氧化为 5-甲酰基胞嘧啶 (5-fC) 和 5-羧基胞嘧啶 (5-caC),最后通过胸腺嘧啶-DNA-糖基化酶 (TDG) 的催化作用,进行碱基切除和 DNA 碱基切除修复 (BER),从而恢复到无甲基状态。

DNA 去甲基化机制:被动与主动

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