在使用 GROMACS 执行 gmx mdrun -deffnm GUA -update gpu -bonded gpu -nb gpu 命令时,遇到了以下错误:

Program:     gmx mdrun, version 2022.2-dev-20220616-4ff81217a4-unknown
Source file: src/gromacs/fft/gpu_3dfft_cufft.cu (line 58)

Fatal error:
cufftPlanMany R2C plan failure (error code 5)

这个错误表示在使用 GPU 进行 FFT 计算时,cufftPlanMany 函数调用失败。错误代码 5 表示 CUFFT_INVALID_VALUE,可能是由于输入参数无效导致的。

要解决这个问题,你可以尝试以下方法:

  1. 确保你的 GPU 驱动程序已经正确安装,并且与 GROMACS 版本兼容。你可以查看 GROMACS 官方文档,了解支持的 GPU 驱动程序版本。
  2. 检查你的输入文件是否正确。确保输入文件中的参数和数据是有效的,并且符合 GROMACS 的要求。
  3. 尝试降低系统的负载。如果你的系统同时运行了其他大型计算任务,可能会导致 GPU 资源不足,从而引发此错误。尝试关闭其他计算任务,或者在空闲时运行 GROMACS。
  4. 尝试使用不同的 GPU 设备。有时,特定的 GPU 设备可能与 GROMACS 不兼容。你可以尝试使用不同的 GPU 设备来看看是否能够解决问题。

如果以上方法都无法解决问题,建议你向 GROMACS 官方论坛或邮件列表寻求帮助。他们的专家可以更好地理解和解决你的问题。

GROMACS mdrun 错误:cufftPlanMany R2C plan failure (error code 5) 解决方案

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