VTK 可视化 3D Unet 分割结果:CT 数据三维展示
使用 VTK 对分割结果进行三维可视化,需要将分割结果转换为 VTK 数据格式。以下是一个示例代码,假设分割结果为一个 numpy 数组 'segmentation',其维度为 '(x, y, z)',表示三维体积的分割结果:
import vtk
import numpy as np
# 创建一个VTK图像数据对象
vtk_data = vtk.vtkImageData()
vtk_data.SetDimensions(segmentation.shape[0], segmentation.shape[1], segmentation.shape[2])
vtk_data.AllocateScalars(vtk.VTK_UNSIGNED_CHAR, 1)
# 将分割结果复制到VTK图像数据对象中
for z in range(segmentation.shape[2]):
for y in range(segmentation.shape[1]):
for x in range(segmentation.shape[0]):
vtk_data.SetScalarComponentFromFloat(x, y, z, 0, segmentation[x, y, z])
# 创建一个VTK颜色映射器
color_func = vtk.vtkColorTransferFunction()
color_func.AddRGBPoint(0, 0, 0, 0) # 背景颜色
color_func.AddRGBPoint(1, 1, 0, 0) # 分割物体颜色
# 创建一个VTK体绘制器
volume_mapper = vtk.vtkSmartVolumeMapper()
volume_mapper.SetInputData(vtk_data)
# 创建一个VTK体属性对象
volume_property = vtk.vtkVolumeProperty()
volume_property.SetColor(color_func)
# 创建一个VTK体对象
volume = vtk.vtkVolume()
volume.SetMapper(volume_mapper)
volume.SetProperty(volume_property)
# 创建一个VTK渲染器
renderer = vtk.vtkRenderer()
renderer.AddVolume(volume)
# 创建一个VTK渲染窗口
render_window = vtk.vtkRenderWindow()
render_window.AddRenderer(renderer)
# 创建一个VTK交互器
interactor = vtk.vtkRenderWindowInteractor()
interactor.SetRenderWindow(render_window)
# 开始渲染
render_window.Render()
interactor.Start()
上述代码将分割结果转换为VTK图像数据对象,并使用体绘制器和体属性对象进行三维可视化。背景颜色为黑色(0, 0, 0),分割物体颜色为红色(1, 0, 0)。可以根据需要修改颜色映射器的设置。
需要注意的是,上述代码中分割结果的维度应该与CT数据的维度一致,以便正确进行可视化。
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