肝癌研究新突破：DNA甲基化如何调控选择性启动子使用？

目前有许多关于肿瘤全基因组甲基化分析的研究论文，这表明肿瘤甲基化是一个备受关注的热点领域。然而，仍然存在许多未解决的问题。过去的研究主要从基因层面对差异甲基化区域的差异表达基因进行分析，而我们的研究从启动子的角度出发，重点关注非差异表达基因的选择性启动子。

选择性启动子与癌症的关系是当前受到广泛关注的新方向。2019年Cell杂志的一篇文章[参考文献79]从泛癌的视角提出了研究启动子活性的重要性，但该研究未具体分析HCC中启动子活性的变化，并未研究选择性使用启动子的原因。基于我们实验室之前的工作，我们推测DNA甲基化状态的改变可能是调控启动子选择性使用的一个重要机制。

通过我们的研究分析，一方面我们在结果3.2部分阐述了选择性启动子对应的基因可能在肝癌的进展中发挥作用（①聚类分析能显著区分肿瘤和正常组织；②富集分析结果显示这些基因能富集到与肿瘤相关的通路；③包括已验证为癌基因的RASSF1，MET，RARA等79个基因）。另一方面，我们在结果3.3部分回答了启动子活性变化与甲基化状态的相关性科学问题（大约52.6%的启动子活性与甲基化状态相关，其中约32.8%呈现负相关）。