MOE分子对接步骤
MOE分子对接步骤如下:
-
准备蛋白质和配体的分子结构文件,并在MOE软件中打开。
-
选择蛋白质和配体的分子结构文件,并在MOE软件中打开。
-
选择“Docking”选项卡,在“Receptor Preparation”中对蛋白质进行准备,包括加氢、去除水分子、修复缺失的原子等。
-
在“Ligand Preparation”中对配体进行准备,包括加氢、去除水分子、修复缺失的原子等。
-
选择“Docking”选项卡,在“Docking Setup”中设置对接参数,包括搜索算法、评分函数、对接范围等。
-
点击“Run Docking”按钮开始对接计算。
-
对接计算完成后,可以通过“Results”选项卡查看对接结果,包括配体的最佳构象、对接评分等。
-
根据对接结果进行分析和优化,包括分析配体与蛋白质的相互作用、优化配体的结构等。
-
最终得到优化后的配体结构,可以进行后续的药物设计和优化。
原文地址: https://www.cveoy.top/t/topic/fHjN 著作权归作者所有。请勿转载和采集!