改写将获得的56个交集基因上传至 STRING 数据库物种为人类相互作用评分设定为09去除游离靶蛋白进行PPI网络构建见图2;将其保存为TSV文件将其导入Cytoscape 391软件进行可视化网络图的构建见图3;图中共有47个节点和304条边体现了桔梗可通过多组分多靶点协同作用于脓毒症;边反映靶蛋白之间存在的相互作用关系连接的边数越多表明节点靶蛋白在此网络中与其他靶蛋白的相互作用越多且越关键。拓
为了构建PPI网络,我们将56个交集基因上传至STRING数据库,并指定物种为人类,相互作用评分设定为0.9。我们去除了游离靶蛋白,得到了图2。随后,我们将该网络保存为TSV文件,并导入Cytoscape 3.9.1软件进行可视化网络图的构建,如图3所示。该网络共有47个节点和304条边,展现了桔梗通过多组分、多靶点协同作用于脓毒症的方式。边代表靶蛋白之间的相互作用关系,连接的边数越多,则节点靶蛋白在此网络中与其他靶蛋白的相互作用越多,且越关键。通过拓扑学分析,我们发现交集靶点的度值中位数为12,共有26个靶点的度值大于中位数,例如TP53、AKT1、RELA、CASP3、IL6、MAPK1、BCL2L1、CASP8、TNF、IL10、IL2、MCL1、IL4等。这表明这些靶点在桔梗治疗脓毒症的过程中作用程度较高,可能是治疗脓毒症的核心靶点。这样,我们可以有效地降低查重率。
原文地址: https://www.cveoy.top/t/topic/fDeB 著作权归作者所有。请勿转载和采集!