CAGE技术：揭示基因转录起始位点和启动子活性

CAGE技术是由日本科学家Hayashizaki[108]提出的一种分子生物学技术，全称为'Cap Analysis of Gene Expression'，即基因表达的帽子分析。该技术通过扩增mRNA 5'端帽子结构连接的RNA序列，并将其与参考基因组进行比对，从而获得基因组mRNA的转录起始位点和相应的5' UTR信息。

CAGE技术的原理是利用mRNA 5'端帽子结构作为标志，特异性地捕获并富集细胞中所有mRNA的5'端序列。然后，对这些序列进行高通量测序，并将其比对到参考基因组上，从而确定转录起始位点的精确位置。

CAGE技术的应用：* 识别基因转录起始位点: CAGE技术可以高精度地识别基因转录起始位点，即使是那些低丰度的转本也能被检测到。* 分析启动子活性: 通过检测CAGE标签的强度，可以推测启动子的转录活性[109]，从而研究基因表达调控机制。* 发现新的转录本: CAGE技术可以帮助研究者发现新的转录本，包括非编码RNA和反义RNA等。

总结: CAGE技术作为一种强大的转录组研究工具，为深入理解基因表达调控机制提供了重要的技术支持。