CAGE技术: 基于mRNA 5'端帽子结构的转录起始位点分析

CAGE技术是由日本科学家Hayashizaki提出的[108], 用于分析基因组mRNA的转录起始位点。该技术通过以下步骤实现: 首先, 扩增mRNA 5'端帽子结构连接的RNA序列; 然后, 将扩增的片段与参考基因组进行比对, 从而获得基因组mRNA的转录起始位点和对应的5' UTR信息。此外, 通过检测CAGE标签的强度, 可以推算启动子的转录活性[109]。