OXT是指C端的羧基氧原子,它是由PDB格式定义的一种特殊的原子类型。由于AMBER力场中没有对OXT的参数定义,因此AMBER无法识别OXT原子类型。在使用AMBER进行模拟计算时,需要将OXT类型的原子转换为标准的COO原子类型,或者手动添加OXT的参数定义。

PDB文件中O原子类型OXT是什么AMBER无法识别

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