药效团模型构建及HipHop方法验证:基于Discovery Studio 2020软件
本文介绍了使用Discovery Studio 2020软件中的常见特征药效团模型构建药效团模型的过程。该模型由药效团特征元素及其在活性分子中的空间排列组成。首先使用DS/Feature mapping选择药效团特征元素,然后使用DS/Common Feature Pharmacophore Generation模块构建药效团模型。在构建过程中,设置了最佳构象生成参数组,最大构象数为200,能量阈值为10,其他参数保持默认值。在特征参数组中,将Feature Mapping模块中化合物的特征映射作为输入特征生成药效团模型。最后,使用验证模块通过输入准备好的测试集中的活性和非活性分子来验证HipHop方法,其他参数保持默认值。
这段话的目的是描述了使用Discovery Studio 2020软件中的特定模块和参数来构建药效团模型,并验证HipHop方法的有效性。
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