解决acpype预测代码中出现的SMILES解析错误

在运行acpype预测代码时,你可能会遇到以下错误提示:

(acpype) sun@wp:/media/sun/yingpan/linux/DLkcat/DLKcat-master/DeeplearningApproach/Code/example$ python prediction_for_input.py input_1.tsv 
input_1.tsv
It's time to start the prediction!
-----------------------------------
[15:21:56] SMILES Parse Error: syntax error while parsing: 'CS(=O)CCCCC(=NOS(=O)(=O)O)SC1C(C(C(C(O1)CO)O)O)O'
[15:21:56] SMILES Parse Error: Failed parsing SMILES 'CS(=O)CCCCC(=NOS(=O)(=O)O)SC1C(C(C(C(O1)CO)O)O)O' for input: 'CS(=O)CCCCC(=NOS(=O)(=O)O)SC1C(C(C(C(O1)CO)O)O)O'
Prediction Done!

根据错误提示信息,可以看出在解析SMILES字符串时出现了语法错误。以下是一些解决方法:

  1. 检查SMILES字符串语法: 仔细检查输入的SMILES字符串是否符合SMILES语法规则,确保没有拼写错误或者其他语法错误。
  2. 参考解析库文档: 如果你使用的是一个特定的SMILES解析库,可以查阅该库的文档,了解解析SMILES字符串的具体要求和限制。
  3. 尝试其他解析工具: 如果输入的SMILES字符串来自于其他来源,例如数据库或者文献,可以尝试使用其他的SMILES解析库或者工具进行解析,以确保解析的准确性。
  4. 寻求专家帮助: 如果以上方法都无法解决问题,可以尝试联系代码的开发者或者相关领域的专家,寻求他们的帮助和建议。

总之,解决SMILES解析错误需要仔细检查输入的SMILES字符串和解析代码,并尝试不同的解析方法,以确保输入的SMILES字符串符合要求并能够被正确解析。

解决SMILES解析错误:acpype预测代码报错

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