在执行enzdes时会准备ligand的params和 rotamer libraries？

是的，在执行enzdes时，会准备ligand的params和rotamer libraries。enzdes是Rosetta软件中的一种蛋白质-小分子相互作用预测算法，需要使用Rosetta的参数文件和库文件来计算蛋白质与小分子之间的相互作用能量。其中，ligand的params文件包含了小分子的化学信息、电荷等参数，rotamer libraries则包含了小分子的构象信息，用于预测小分子在蛋白质中的构象。在执行enzdes时，Rosetta会根据小分子的化学结构和蛋白质的结构信息，自动准备ligand的params和rotamer libraries。