在Rosetta中,"weights"参数用于指定能量函数的权重文件。"ligand_soft_rep"和"ligand_soft_rep.wts"都是能量函数中与配体相关的权重文件。

区别在于,"ligand_soft_rep"是一个默认的权重文件名,如果在命令行或脚本中未指定具体的权重文件名,则会自动使用该文件。而"ligand_soft_rep.wts"则是具体的权重文件名,需要在命令行或脚本中显式指定。

因此,两者的区别在于是否需要显式指定文件名。如果只使用默认的权重文件,则可以使用"ligand_soft_rep";如果需要使用其他名字的权重文件,则需要使用"ligand_soft_rep.wts"并在命令行或脚本中指定。


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