rdkit生成小分子构象库时小分子的生理电荷为-1

RDKit生成小分子构象库时并不会默认设定小分子的生理电荷为-1，而是根据具体情况进行计算。RDKit提供了多种方法来计算小分子的电荷，包括基于分子力学的方法、基于量子化学的方法、基于药效学的方法等。用户可以根据自己的需求选择适合的方法来计算小分子的电荷。

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