path_to_bclbcl moleculeConformerGenerator ensemble_filenames output_ligand_file_1sdf conformers_single_file ouput_ligand_file_2sdf 什么意思需要什么软件完成
这是一个命令行指令,需要在命令行界面下使用。其中:
- path_to_bcl/bcl molecule:表示路径到BCL(BioChemical Library)的分子模块。
- ConformerGenerator:表示使用BCL中的ConformerGenerator模块。
- ensemble_filenames:表示输入的分子文件,可以是一个或多个文件。
- output_ligand_file_1.sdf:表示输出的第一个分子文件的名称和格式,这里是SDF格式。
- conformers_single_file:表示将所有生成的构象保存在一个文件中。
- ouput_ligand_file_2.sdf:表示输出的第二个分子文件的名称和格式,这里是SDF格式。
这个命令的作用是使用BCL中的ConformerGenerator模块,从输入的分子文件中生成构象,并将生成的构象保存到两个SDF格式的文件中。这个命令需要在安装了BCL软件的计算机上运行。
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