与具有静态稳定特点的基因组不同转录组同时受外源和内源因子共同作用体现生物个体某一特定发育、生理时期下特定器官、组织或细胞中所有基因表达水平可用来比较基因在不同组织或生理状况下选择性表达差异通过研究某一特定发育、生理时期下特定组织或细胞中全部转录本所具有的种类、结构和功能信息以及转录调控规律能够展现有关基因的表达调控和蛋白质的功能、相互作用的信息研究与特定生理功能有关的基因预测未知基因。换个说法

转录组和基因组不同，它反映了生物在某一特定发育、生理时期下特定器官、组织或细胞中所有基因表达水平。它可以帮助我们比较基因在不同组织或生理状况下的选择性表达差异，从而研究某一特定发育、生理时期下特定组织或细胞中全部转录本所具有的种类、结构和功能信息，并揭示转录调控规律。通过转录组的研究，我们可以了解基因的表达调控和蛋白质的功能、相互作用的信息，预测未知基因，更好地研究与特定生理功能有关的基因。