rosetta运行求助Executable = workdavisligand_docklinuxiccreleaseUniverse = vanillaInitialdir = workdavisprojectsjnk_samplArguments = FLAGStxt -infiles inputjnk_pp_1_001pdb -outpathpdb workjnk_pp_1_001$Proc

在普通的终端命令行中，可以将Executable和Initialdir改为本地文件路径，如：

Executable = /home/user/ligand_dock.linuxiccrelease Initialdir = /home/user/projects/jnk_sampl

Arguments = @FLAGS.txt -in:file:s input/jnk_pp_1_001.pdb -out:path:pdb /home/user/projects/jnk_sampl/work/jnk_pp_1_001/$(Process) -run:seed_offset $(Process) -out:suffix _$(Process) Queue 10

需要注意的是，本地文件路径需要根据实际情况进行修改。另外，如果在本地终端命令行中运行，需要安装和配置相应的软件和环境。